More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12221 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  88.67 
 
 		 203 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  88.67 
 
 		 203 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  85.71 
 
 		 220 aa  358  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  84.73 
 
 		 220 aa  353  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  85.28 
 
 		 197 aa  341  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  84.26 
 
 		 197 aa  339  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  84.26 
 
 		 197 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  84.26 
 
 		 197 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  83.25 
 
 		 197 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  79.51 
 
 		 205 aa  330  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  87.22 
 
 		 180 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  68.45 
 
 		 209 aa  291  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  68.63 
 
 		 208 aa  289  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  69.7 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  67.98 
 
 		 200 aa  278  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  66.02 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  70.72 
 
 		 181 aa  261  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  65.26 
 
 		 199 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  63.13 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  60.29 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  59.28 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  57.73 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  58.59 
 
 		 212 aa  221  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  59.79 
 
 		 205 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  60.22 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  55.61 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  61.31 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 		 224 aa  217  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.77 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  53.74 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  56.08 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  56.57 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  56.19 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  51.79 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  56.28 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  54.55 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  58.02 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  51.53 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.24 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  46.38 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  44.02 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  37.76 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  37.37 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.96 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  37.19 
 
 		 198 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.77 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  37.77 
 
 		 206 aa  111  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.95 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.61 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.47 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.47 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  35.68 
 
 		 292 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  35.51 
 
 		 292 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.93 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.93 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.36 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.08 
 
 		 283 aa  101  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  35.43 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.45 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.53 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  33.5 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  31.53 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34 
 
 		 743 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.72 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.48 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.89 
 
 		 295 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.63 
 
 		 298 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.53 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.49 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  40.65 
 
 		 279 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  38.83 
 
 		 285 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.51 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.19 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.1 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  35.91 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.1 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  32.22 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 		 284 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.95 
 
 		 222 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0257  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.9 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 		 295 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 		 295 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.11 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  32.6 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>