More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  100 
 
 		 213 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  83.57 
 
 		 213 aa  363  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  78.4 
 
 		 215 aa  338  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  78.33 
 
 		 218 aa  331  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  73.24 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  68.08 
 
 		 224 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  69.48 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  64.32 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  62.91 
 
 		 215 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  65.4 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.72 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  56.56 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  64.02 
 
 		 217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  57.21 
 
 		 205 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  58.71 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  57.92 
 
 		 208 aa  230  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  58.69 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  60.56 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  60.56 
 
 		 203 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  60.56 
 
 		 203 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  57.75 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  55.56 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  57.75 
 
 		 200 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  59.18 
 
 		 205 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  59.62 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  61.81 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  58.29 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  57.35 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  57.35 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  57.35 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  56.87 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  58.77 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  63.02 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  53.92 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  58.85 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.5 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  55.5 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  51.77 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  57.81 
 
 		 181 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  51.1 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  54.79 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  42.45 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.92 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  36.73 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  36.15 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.64 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.82 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34.2 
 
 		 743 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  38.24 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.23 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  37.56 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.34 
 
 		 283 aa  98.2  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.18 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.66 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  38.02 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.18 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  38.22 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  33.18 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.58 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.59 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  32.71 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  29.38 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 298 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  29.3 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.73 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.16 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  29.73 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.59 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.75 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.23 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.29 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.22 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  31.46 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  31.35 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.19 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  35.21 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  29.73 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  30.45 
 
 		 291 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.19 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  41.22 
 
 		 293 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.28 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.18 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.73 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.55 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>