More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1809 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  91.04 
 
 		 239 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  64.95 
 
 		 209 aa  250  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  60.37 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  62.37 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  63.73 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  60.66 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  58.29 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  60.19 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 220 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  60.82 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  60.7 
 
 		 200 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  61.86 
 
 		 205 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  60.31 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  61.06 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  57.73 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  55.9 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  60.53 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  62.63 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  58.33 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  56.39 
 
 		 215 aa  222  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  56.42 
 
 		 205 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  58.5 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  59.69 
 
 		 181 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  53.27 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  55.71 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  51.33 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  52 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  50.88 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  51.1 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  53.27 
 
 		 211 aa  195  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  56.28 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  50.91 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.03 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  44.64 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  47.49 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  42.16 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.41 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.88 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 		 298 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  33.64 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  37.09 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  39.27 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  39.27 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  35.96 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.47 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  35.18 
 
 		 291 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  38.22 
 
 		 206 aa  104  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  33.8 
 
 		 198 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.18 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  35.68 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  35.38 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34.04 
 
 		 743 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.31 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  38.1 
 
 		 293 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  34.87 
 
 		 292 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  38.46 
 
 		 293 aa  98.2  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.32 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  37.66 
 
 		 295 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  38.31 
 
 		 295 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  34.15 
 
 		 295 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.97 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  39.49 
 
 		 291 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.88 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  37.66 
 
 		 295 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.99 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  36.76 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.92 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  32.35 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  36.54 
 
 		 291 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  35.38 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  37.58 
 
 		 293 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  36.94 
 
 		 291 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.04 
 
 		 294 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.29 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  36.31 
 
 		 291 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  32.03 
 
 		 291 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  34.98 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.29 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  36.31 
 
 		 279 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 291 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  35.68 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40 
 
 		 296 aa  91.3  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  34.02 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  36.31 
 
 		 291 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  36.31 
 
 		 291 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  32.2 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  35.67 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  34.8 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  35.38 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>