More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3063 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  68.81 
 
 
205 aa  285  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  66.52 
 
 
215 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  73.83 
 
 
205 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  64.02 
 
 
213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  63.89 
 
 
215 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  62.56 
 
 
219 aa  263  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  63.46 
 
 
213 aa  261  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  65.84 
 
 
218 aa  261  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  64.02 
 
 
211 aa  260  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  64.71 
 
 
194 aa  258  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  60.75 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  62.56 
 
 
208 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  61.5 
 
 
212 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  65.84 
 
 
206 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  56.88 
 
 
217 aa  241  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  58.04 
 
 
223 aa  241  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  63.68 
 
 
205 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  62.26 
 
 
203 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  62.26 
 
 
203 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.42 
 
 
212 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  56.4 
 
 
244 aa  222  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  56.58 
 
 
239 aa  222  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  64.1 
 
 
180 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  58.22 
 
 
206 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  59.05 
 
 
197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  62.63 
 
 
204 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  58.69 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  57.75 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  58.49 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  58.49 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  58.49 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  58.02 
 
 
203 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  58.96 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  56.28 
 
 
212 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  58.57 
 
 
220 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  57.48 
 
 
199 aa  215  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.61 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  56.07 
 
 
199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  56.94 
 
 
200 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  60.51 
 
 
181 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  42.4 
 
 
198 aa  144  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  38.5 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  37.31 
 
 
210 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.5 
 
 
214 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.07 
 
 
195 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 
207 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 
283 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  34.78 
 
 
206 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  38.38 
 
 
205 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 
205 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
208 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  35.05 
 
 
198 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.83 
 
 
222 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.48 
 
 
204 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.9 
 
 
298 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.63 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.97 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.97 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.95 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  38.5 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  33.02 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  32.54 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.2 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 
203 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.29 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  42.28 
 
 
293 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.8 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.81 
 
 
221 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.8 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.85 
 
 
209 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  35.24 
 
 
291 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  40 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.62 
 
 
210 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
210 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.11 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  34.74 
 
 
295 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.47 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  31.94 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.65 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.65 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4892  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  35.03 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.65 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 
291 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.65 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.68 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  32.72 
 
 
743 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.65 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.48 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.29 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  34.21 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>