More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1373 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  78.47 
 
 		 209 aa  328  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  71.22 
 
 		 220 aa  292  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  73.74 
 
 		 203 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  73.74 
 
 		 203 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  72.73 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  72.45 
 
 		 197 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  72.45 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  70.5 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  70.92 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  69.7 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  70.92 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  70.92 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  71.07 
 
 		 206 aa  279  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  66.83 
 
 		 200 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  65.22 
 
 		 208 aa  269  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  74.3 
 
 		 180 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  66.15 
 
 		 199 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  65.64 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  63.73 
 
 		 239 aa  239  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  63.73 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  61.68 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  66.11 
 
 		 181 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  61.31 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  63.98 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  58.49 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  62.77 
 
 		 194 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  59.62 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  62.9 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  62.77 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  59.81 
 
 		 213 aa  217  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.74 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  61.11 
 
 		 218 aa  214  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.85 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  57.01 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  59.09 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  53.11 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.08 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  62.94 
 
 		 217 aa  195  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.3 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.87 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  46.45 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.86 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  42.29 
 
 		 298 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  38.17 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.02 
 
 		 283 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.51 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.88 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.76 
 
 		 198 aa  104  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  35.07 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  37.02 
 
 		 743 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  46.15 
 
 		 296 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  34.97 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  32.6 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  44.36 
 
 		 293 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  36.1 
 
 		 273 aa  98.6  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 295 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  35.67 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.88 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.07 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  36 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.07 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.48 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  43.08 
 
 		 291 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.31 
 
 		 295 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  35.11 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4892  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  32.78 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.4 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  34.6 
 
 		 292 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  41.54 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  41.54 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  34.6 
 
 		 292 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.2 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.31 
 
 		 295 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.31 
 
 		 295 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.85 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  41.54 
 
 		 291 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 295 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  34.93 
 
 		 285 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  40.77 
 
 		 291 aa  92  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.53 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  34.93 
 
 		 285 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  32.04 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>