More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0120 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 295 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  98.64 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  98.64 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  93.56 
 
 		 295 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  80.68 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  78.64 
 
 		 295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  78.64 
 
 		 295 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  76.79 
 
 		 298 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  73.97 
 
 		 296 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  63.73 
 
 		 295 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  55.93 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  55.59 
 
 		 291 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  55.25 
 
 		 291 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  57.43 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  59.12 
 
 		 291 aa  318  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  59.12 
 
 		 291 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  59.12 
 
 		 291 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  55.33 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  57.77 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  57.77 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  58.45 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  57.43 
 
 		 291 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  56.46 
 
 		 293 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  53.9 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  57.09 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  54.42 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  56.42 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  54.24 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  56.08 
 
 		 291 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  55.25 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  55.59 
 
 		 291 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  53.42 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  54.58 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  57.04 
 
 		 291 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  52.36 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  50.17 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  53.06 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  51.38 
 
 		 284 aa  279  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  50.34 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  51.19 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  51.37 
 
 		 288 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  54.76 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  47.26 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  51.51 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  51.2 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  48.98 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  47.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  47.44 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  50.68 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  47.81 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  46.74 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  46.42 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  49.66 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  47.14 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  49.66 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  46.74 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  48.97 
 
 		 285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  49.32 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  49.32 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  51.71 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  46.74 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  54.11 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  48.28 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  49.32 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  46.05 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  45.36 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  49.66 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  48.97 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  48.62 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  48.62 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  47.62 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  46.05 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  41.41 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  42.57 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  41.41 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  41.33 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  41.47 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  40.07 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  41.47 
 
 		 285 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  40.79 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  40.61 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 		 284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  41.22 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  41 
 
 		 439 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  41 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 		 274 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  41.22 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  40.33 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  40.54 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  41.41 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>