More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3134 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  62.91 
 
 		 213 aa  281  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  60.38 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  61.79 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  65.71 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  62.79 
 
 		 215 aa  275  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  64.22 
 
 		 218 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  61.86 
 
 		 219 aa  274  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  60.09 
 
 		 213 aa  267  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  60.83 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  63.32 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  66.52 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  62.1 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  64.19 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  62.2 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  61.61 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  62.68 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  61.69 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  62.1 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  60.98 
 
 		 194 aa  244  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  56 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  61.68 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  57.41 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  57.94 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  57.52 
 
 		 239 aa  228  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  52.27 
 
 		 244 aa  226  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  59.05 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  56.54 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  56.54 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  58.1 
 
 		 197 aa  224  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  58.1 
 
 		 197 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  58.1 
 
 		 197 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  56.39 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  56.11 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  57.14 
 
 		 197 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  57.35 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  56.36 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  59.38 
 
 		 180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  53.74 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  55.35 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  55.96 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  44.67 
 
 		 198 aa  148  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  35.35 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.49 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.1 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  33.97 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.79 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.79 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  36.32 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  35.35 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.53 
 
 		 206 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.85 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  34.26 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.68 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.84 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.2 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  35.57 
 
 		 283 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.34 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.18 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  38 
 
 		 298 aa  99  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.81 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.01 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  31.4 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  32.66 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 295 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.72 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.72 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  30.92 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.72 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  30.92 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  33.68 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  31.07 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.17 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.28 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  39.58 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  31.07 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  33.65 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  31.07 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  31.19 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.18 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  31.92 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.36 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  31.36 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  29.03 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  33.66 
 
 		 200 aa  92  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.19 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  30.5 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>