More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2008 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  77.46 
 
 
213 aa  339  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  78.44 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  73.56 
 
 
213 aa  322  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  69.81 
 
 
211 aa  299  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  66.05 
 
 
224 aa  293  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  66.36 
 
 
219 aa  290  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  66.98 
 
 
212 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  64.22 
 
 
215 aa  279  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  64.62 
 
 
212 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  60.19 
 
 
217 aa  258  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  64.38 
 
 
217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  61.42 
 
 
206 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.26 
 
 
244 aa  232  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  61.73 
 
 
205 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  56.62 
 
 
205 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  58.14 
 
 
203 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  58.14 
 
 
203 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  57.01 
 
 
205 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  59.17 
 
 
204 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  57.14 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  57.14 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  57.14 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  57.14 
 
 
197 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  57.21 
 
 
220 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  57.62 
 
 
197 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  57.08 
 
 
208 aa  217  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  56.48 
 
 
209 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  53.49 
 
 
223 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  55 
 
 
220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  55.19 
 
 
200 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  54.67 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  57.77 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  54.72 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  54.42 
 
 
203 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  54.72 
 
 
199 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  53.78 
 
 
212 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  59.38 
 
 
180 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  54.95 
 
 
208 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  56.77 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  51.15 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  41.71 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.21 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 
195 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 
197 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.41 
 
 
206 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 
214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  33.95 
 
 
198 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.18 
 
 
210 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.85 
 
 
204 aa  101  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.45 
 
 
203 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35 
 
 
743 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  37.37 
 
 
206 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.18 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  35.21 
 
 
198 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.97 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.69 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.69 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.97 
 
 
204 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 
283 aa  95.5  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 
202 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.47 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.02 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.17 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  38.34 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  30.88 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.43 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.14 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.14 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  35.68 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.79 
 
 
203 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  34.53 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.43 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.73 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.89 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  42.07 
 
 
293 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.74 
 
 
222 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
205 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.68 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30.24 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.89 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.68 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.56 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.29 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  29.91 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.63 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.99 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.52 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.99 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.99 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.99 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.52 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.99 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.51 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.51 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>