More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3557 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
220 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  95.91 
 
 
220 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  92.12 
 
 
203 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  92.12 
 
 
203 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  89.34 
 
 
197 aa  358  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  89.34 
 
 
197 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  89.34 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  89.34 
 
 
197 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  89.34 
 
 
197 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  84.73 
 
 
203 aa  353  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  84.39 
 
 
205 aa  349  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  91.67 
 
 
180 aa  331  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  72.33 
 
 
209 aa  300  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  71.22 
 
 
204 aa  292  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  71.08 
 
 
208 aa  292  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  71.28 
 
 
206 aa  281  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  70.9 
 
 
200 aa  274  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  65.26 
 
 
199 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  64.74 
 
 
199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  68.51 
 
 
181 aa  250  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  60.82 
 
 
212 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  60.82 
 
 
239 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  59.6 
 
 
224 aa  228  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  58.57 
 
 
208 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  62.31 
 
 
213 aa  224  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  58.59 
 
 
212 aa  224  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  62.03 
 
 
206 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  59.62 
 
 
213 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  60.1 
 
 
215 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  56.36 
 
 
215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  59.26 
 
 
194 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  61.83 
 
 
205 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  57.58 
 
 
205 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  59.3 
 
 
218 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  57.14 
 
 
211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  52.97 
 
 
219 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  52.23 
 
 
223 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  52.79 
 
 
217 aa  201  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.57 
 
 
212 aa  198  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  58.57 
 
 
217 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  47.55 
 
 
244 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  43.48 
 
 
198 aa  147  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  38.27 
 
 
211 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.67 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.45 
 
 
210 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
214 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.74 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  37.88 
 
 
197 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.18 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.79 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  39.34 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  39.34 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.85 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  36.07 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.67 
 
 
202 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.98 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  36.32 
 
 
292 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34.5 
 
 
743 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  36.32 
 
 
292 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 
283 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.89 
 
 
296 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  40.91 
 
 
279 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  35.96 
 
 
273 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  35.45 
 
 
201 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  36.56 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  33.15 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.34 
 
 
204 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.93 
 
 
298 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  34.68 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.05 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.34 
 
 
204 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.42 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.71 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.72 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.68 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 
285 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.81 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.71 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 
285 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.72 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 
293 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  34.18 
 
 
291 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.1 
 
 
199 aa  95.5  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.79 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.46 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  36.9 
 
 
285 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0667  quinol oxidase subunit III  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0611  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0612  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  34.07 
 
 
286 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.05 
 
 
202 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  34.32 
 
 
287 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>