More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  100 
 
 
217 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  63.43 
 
 
219 aa  285  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  60.75 
 
 
215 aa  268  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  60.83 
 
 
215 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  61.9 
 
 
211 aa  265  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  64.14 
 
 
218 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.72 
 
 
213 aa  254  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  63.13 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.6 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  59.9 
 
 
224 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  57.34 
 
 
212 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  54.5 
 
 
200 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  54.03 
 
 
199 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  54.5 
 
 
199 aa  223  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  56.48 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.89 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  55.61 
 
 
205 aa  218  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  56.88 
 
 
217 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  53.3 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  54.31 
 
 
203 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  54.31 
 
 
203 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  53.27 
 
 
205 aa  208  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  50.69 
 
 
223 aa  207  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  49.77 
 
 
208 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  53.81 
 
 
197 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  53.3 
 
 
197 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  53.3 
 
 
197 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  53.3 
 
 
197 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  51.23 
 
 
194 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  53.3 
 
 
197 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  52.79 
 
 
220 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  52.28 
 
 
220 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  50.48 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  54.17 
 
 
180 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  53.3 
 
 
204 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  49.24 
 
 
203 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  49.1 
 
 
239 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.28 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  48.62 
 
 
206 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  49.03 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  51.3 
 
 
181 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  41.71 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  38.69 
 
 
197 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.62 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  37.11 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.08 
 
 
208 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.08 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  38.14 
 
 
210 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  34.84 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.68 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  37.11 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 
205 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  34.72 
 
 
205 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  34.52 
 
 
198 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.86 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.83 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.02 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.74 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  32.64 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.29 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  31.02 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 
298 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.09 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.86 
 
 
204 aa  89  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  32.42 
 
 
743 aa  88.6  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.55 
 
 
222 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  32.35 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  32.54 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.37 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 
206 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  32.57 
 
 
200 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  32.24 
 
 
201 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 
206 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  34.72 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.93 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.13 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5791  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.28 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0858154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 
293 aa  84.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.37 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.9 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.04 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.95 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.3 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30.37 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  33.83 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.41 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  34.64 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  28.9 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.41 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.38 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.58 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  35.48 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.88 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.88 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>