More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0039 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  54.75 
 
 		 295 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  56.86 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  56.86 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  54.25 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  49.84 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  54.25 
 
 		 295 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 		 291 aa  292  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  51.31 
 
 		 291 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  50.49 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  53.57 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  53.92 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  52.44 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  53.77 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  48.08 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  52.75 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  52.75 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  50.16 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  52.13 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  52.13 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  52.79 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  51.8 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  52.46 
 
 		 291 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  52.46 
 
 		 291 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  51.48 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  52.46 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  52.1 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  48.22 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  51.31 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  49.18 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  50.5 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  51.15 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  51.16 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  48.39 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  48.69 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  46.05 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  46.33 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  45.85 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  48.33 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  44.7 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  48.36 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  44.12 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  44.33 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  45.85 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  45.03 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  43.61 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  43.71 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  43.71 
 
 		 293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  47.57 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  46.71 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  44.33 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  46.84 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  45.28 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  42.38 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  46.84 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  45.36 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  46.95 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  45.95 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  45.03 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  45.36 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  45.27 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  45.27 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  43.28 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  44.04 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  43.19 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  43.71 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  43.19 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  42.05 
 
 		 285 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  46.33 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  44.19 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  43.52 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  44.19 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  44.19 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  44.19 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  43.52 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  42.52 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  33.77 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  33.12 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  37.95 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  34.53 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  36.88 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  35.1 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  34.74 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  33.77 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  35.31 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  35.03 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  34.74 
 
 		 439 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  34.2 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  34.44 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  33.12 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  33.88 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>