More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0106 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
208 aa  420  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  52.6 
 
 
203 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  51.56 
 
 
202 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  43.52 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  39.27 
 
 
206 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  37.67 
 
 
234 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  39.15 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  38.22 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  38.22 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  38.22 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  32.2 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.2 
 
 
211 aa  111  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.76 
 
 
283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  35.53 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  34.88 
 
 
231 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
248 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
234 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  34.45 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  32.69 
 
 
743 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  35.85 
 
 
240 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.23 
 
 
210 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
298 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
241 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.78 
 
 
209 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.78 
 
 
209 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 
195 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.18 
 
 
209 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  35.85 
 
 
240 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
239 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  34.13 
 
 
209 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 
211 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  34.5 
 
 
240 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  31.95 
 
 
265 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2644  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
207 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.252638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 
209 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  32.72 
 
 
208 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  32.64 
 
 
198 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.22 
 
 
211 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  33.81 
 
 
291 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  33.96 
 
 
239 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 
194 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  33.49 
 
 
236 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.28 
 
 
204 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.28 
 
 
204 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.58 
 
 
204 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  34.42 
 
 
832 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  33.96 
 
 
234 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  33.03 
 
 
214 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  31.69 
 
 
304 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  37.24 
 
 
295 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.98 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.22 
 
 
211 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  34.43 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  34.43 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  32.81 
 
 
251 aa  98.2  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  32.34 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  32.34 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.62 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.29 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  34.04 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.81 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.11 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7137  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.86 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  32.98 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  35.5 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  29.11 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.62 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.66 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  35.48 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.45 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.45 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.66 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.16 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  38.54 
 
 
319 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.57 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.68 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  32.02 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  33.01 
 
 
291 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.97 
 
 
291 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.04 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>