More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2477 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  79.66 
 
 
239 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  84.3 
 
 
239 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  74.58 
 
 
240 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  72.61 
 
 
241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  70.42 
 
 
240 aa  350  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  73.28 
 
 
231 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  72.44 
 
 
234 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  72 
 
 
234 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  69.37 
 
 
236 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  69.51 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  67.25 
 
 
240 aa  277  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  66.81 
 
 
240 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  68.7 
 
 
234 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  65.94 
 
 
239 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  66.23 
 
 
230 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  66.23 
 
 
230 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  60.18 
 
 
225 aa  255  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  45.09 
 
 
224 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  39.92 
 
 
265 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  41.98 
 
 
256 aa  148  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  40.56 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
235 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  41.5 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.1 
 
 
204 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  35.51 
 
 
832 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.82 
 
 
203 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.5 
 
 
208 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  35.5 
 
 
208 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 
204 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.65 
 
 
221 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  33.94 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  30.64 
 
 
226 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  33.98 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  36.11 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  32.74 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.01 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.01 
 
 
206 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 
209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  40.62 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  33.5 
 
 
205 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 
209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33 
 
 
825 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  32.14 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5374  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  34.52 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.99 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  33.5 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
202 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.12 
 
 
202 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  30.7 
 
 
209 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  32.84 
 
 
205 aa  92  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.63 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1211  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.65 
 
 
202 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  30.61 
 
 
214 aa  92  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  29.96 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.7 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  30.73 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  30.67 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2088  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.65 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.49 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6008  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0674382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2069  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.99 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.16 
 
 
295 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
197 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.61 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4892  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 
215 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  32.14 
 
 
208 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  36.65 
 
 
200 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
201 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  32.65 
 
 
197 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.77 
 
 
819 aa  89  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
197 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.52 
 
 
208 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>