More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0250 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  74 
 
 		 200 aa  271  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  63.5 
 
 		 199 aa  259  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  67.5 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  56.63 
 
 		 199 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  58.79 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  51.27 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  55.44 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  49.75 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  48.45 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  42.79 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  41.36 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  41.79 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  41.79 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  40.39 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  43.37 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  41.46 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  42.11 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  41.95 
 
 		 234 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  41.46 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  39.18 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  41.58 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  40.72 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  37.06 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  39.8 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  34.8 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  39.3 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  35.68 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  39.79 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  38.5 
 
 		 215 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  30.83 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  32.3 
 
 		 262 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  38.17 
 
 		 832 aa  108  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  35.79 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  34.17 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  36.87 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  36.87 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  36.87 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  34.63 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  34.92 
 
 		 819 aa  99  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  33.95 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.82 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  32.69 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  32.87 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.29 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.85 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.18 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  34.29 
 
 		 231 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.41 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  33.86 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.89 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  34.13 
 
 		 234 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 		 234 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  32.5 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.63 
 
 		 825 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  29.74 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.28 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.5 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  35.03 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  30.26 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.65 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  33.18 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  31.94 
 
 		 240 aa  84.7  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  32.62 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  32.67 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  30.29 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  34.69 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.8 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.8 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.41 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.67 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.27 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  30.73 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.27 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  31.42 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  30.37 
 
 		 827 aa  78.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  29.38 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.59 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  30.5 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  32.47 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.66 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  27.27 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  34.36 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>