More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6231 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  75.12 
 
 
229 aa  321  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  74.18 
 
 
229 aa  318  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  73.83 
 
 
229 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  59.26 
 
 
225 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  56.16 
 
 
215 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  51.38 
 
 
211 aa  214  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  40.71 
 
 
214 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  44.06 
 
 
209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  38.28 
 
 
234 aa  148  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  43.72 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 
209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  38.05 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  33.05 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  40.31 
 
 
215 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.35 
 
 
226 aa  121  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  37.31 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  32.9 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  34.52 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  35.78 
 
 
235 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  36.24 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  34.75 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  38.02 
 
 
196 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  34.65 
 
 
211 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  37.63 
 
 
199 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  30.87 
 
 
262 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  36.27 
 
 
199 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  37.95 
 
 
200 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  34.87 
 
 
199 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.51 
 
 
200 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  38.97 
 
 
201 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  35.27 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  36.96 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  35.2 
 
 
198 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  35.33 
 
 
184 aa  88.2  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  31.05 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  29.77 
 
 
825 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  32.07 
 
 
832 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.18 
 
 
819 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  30.95 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.46 
 
 
827 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  28.78 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.24 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 
199 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  29.82 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  31.11 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  39.13 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  31.25 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  29.52 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.38 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  32.47 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  34.78 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.41 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  31.6 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.43 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.43 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  31.02 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  30.37 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.35 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.35 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  29.26 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  32.68 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  31.44 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  31.44 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  31.44 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  31.03 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  31.53 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  31.52 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  31.52 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 
211 aa  72  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.37 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  25 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  32.31 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.91 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  31.52 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  30.73 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  39.13 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  40.71 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  28.02 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  27.86 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  28.08 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>