More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0026 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  79.3 
 
 		 229 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  78.41 
 
 		 229 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  73.83 
 
 		 225 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  58.45 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  56.95 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  54.34 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  39.29 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  39.69 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  38.6 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  36.74 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.75 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  37.19 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  39.47 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  31.96 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  35.44 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.85 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  34.57 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  34.44 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.96 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.96 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  38.1 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  34.45 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  37.11 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  36.27 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  33.18 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  39.27 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 		 184 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  36.92 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  36.65 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  28.21 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  36.6 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.79 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  29.28 
 
 		 819 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  30.65 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  32.12 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  29.86 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.28 
 
 		 827 aa  85.1  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.63 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.65 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  29.57 
 
 		 825 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.35 
 
 		 832 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  38.8 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  25.93 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  28.92 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  34.97 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  31.38 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  27.45 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  33.88 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  27.87 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  29.63 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.63 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.63 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  29.41 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.1 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.1 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  29.17 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  29.1 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  27.96 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.27 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  27 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  27.42 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  26.63 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  26.74 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  30.05 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  32.31 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  28.71 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  26.09 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  29.02 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  28.49 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  28.49 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  27.98 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  27.13 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.38 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  26.96 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  26.96 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  27.4 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  26.92 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  27.27 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  25.64 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  24.29 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>