More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2086 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  100 
 
 
192 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  61.83 
 
 
202 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  54.91 
 
 
184 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  46.45 
 
 
184 aa  154  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  48.09 
 
 
183 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  39.8 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  47.4 
 
 
187 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  48.85 
 
 
198 aa  141  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  41.97 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  41.38 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.5 
 
 
204 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  48.24 
 
 
202 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  51.85 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  44.39 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  40.78 
 
 
197 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  43.65 
 
 
190 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  41.44 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  45.73 
 
 
234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  34.87 
 
 
200 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  32.83 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  32.83 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  37.02 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  44 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.32 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  39.44 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  39.44 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  39.44 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.04 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35.56 
 
 
209 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 
209 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35.56 
 
 
209 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 
209 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35 
 
 
209 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35 
 
 
209 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.68 
 
 
193 aa  101  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  36.18 
 
 
194 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 
243 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 
224 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  33.89 
 
 
208 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  31.42 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 
234 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
209 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  32.66 
 
 
235 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  31.53 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 
209 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.26 
 
 
211 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 
226 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  34.41 
 
 
214 aa  91.3  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.5 
 
 
234 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.39 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.6 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 
208 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 
191 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  32.92 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  32.92 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  33.82 
 
 
225 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  29 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  33.82 
 
 
199 aa  84.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  28.99 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.54 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  28.33 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  26.46 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  30.94 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.59 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  31.18 
 
 
215 aa  82  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  33.14 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.64 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.64 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  29.44 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  30.06 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  28.33 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  30.29 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.84 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23186  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  30.64 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  30.06 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  28.9 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.11 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  31.87 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.79 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.09 
 
 
244 aa  79  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.76 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.32 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.9 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.68 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.68 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.68 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.68 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>