More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06790 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  100 
 
 		 175 aa  340  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  97.71 
 
 		 190 aa  290  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  46.86 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  43.68 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  44.57 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  42.2 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  41.38 
 
 		 208 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  42.29 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  43.43 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  42.53 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 		 204 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  38.86 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  37.71 
 
 		 243 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 		 226 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  48 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  37.14 
 
 		 206 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  43.68 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  35.43 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  35.63 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  34.48 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  34.48 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  34.48 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  34.48 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  37.36 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  37.36 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  37.36 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.91 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.91 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  35.68 
 
 		 224 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.57 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  36.67 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  34.29 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  32.76 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  40.7 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  33.91 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.11 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  31.18 
 
 		 214 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 		 234 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  38.95 
 
 		 189 aa  94  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  30.98 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  32.66 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  33.91 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  37.14 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  28.12 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  91.3  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  33.71 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  39.76 
 
 		 234 aa  91.3  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 209 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  31.61 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  34.48 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.49 
 
 		 209 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.49 
 
 		 209 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  34.16 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  33.14 
 
 		 198 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  33.14 
 
 		 198 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 		 234 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29.03 
 
 		 211 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  34.04 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  30.59 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  35.92 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  32.95 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  35.1 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  34.44 
 
 		 295 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  34.44 
 
 		 295 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  35.1 
 
 		 295 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.67 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  29.23 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  27.03 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  34.87 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.14 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.11 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  28.48 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  28.98 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  32.47 
 
 		 295 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  37.77 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  34.21 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  29.31 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.22 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.41 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  35.94 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.7 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  38.51 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  30.6 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.41 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  28.9 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  28.9 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  39.02 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  32.06 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  28.82 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>