More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0296 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  56.45 
 
 
291 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  55.02 
 
 
291 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  54.55 
 
 
288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  57.53 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  53.5 
 
 
288 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  53.66 
 
 
284 aa  289  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  51.58 
 
 
284 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  55.87 
 
 
291 aa  287  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  50.17 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  51.36 
 
 
295 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  51.19 
 
 
291 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  50.51 
 
 
291 aa  278  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  50.34 
 
 
293 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  52.69 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  55.05 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  53.82 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  49.32 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  54.7 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 
293 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  52.7 
 
 
296 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  52.38 
 
 
295 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 
285 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 
285 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 
285 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 
285 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 
285 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  53.05 
 
 
286 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 
285 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  52.38 
 
 
295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  48.98 
 
 
291 aa  268  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  51.26 
 
 
285 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  50.68 
 
 
295 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  50.9 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  49.82 
 
 
294 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  47.44 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  53.74 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  50.34 
 
 
291 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  48.98 
 
 
293 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  50.34 
 
 
293 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  50.54 
 
 
285 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  49.32 
 
 
295 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  50.54 
 
 
285 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  50.54 
 
 
285 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  52.71 
 
 
286 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  49.66 
 
 
293 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  52.38 
 
 
293 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  50.17 
 
 
293 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  51.61 
 
 
286 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  51.61 
 
 
286 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  51.25 
 
 
286 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  51.02 
 
 
298 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  49.83 
 
 
293 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  48.98 
 
 
295 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  48.98 
 
 
295 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  49.83 
 
 
293 aa  258  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  52.71 
 
 
290 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  51.36 
 
 
291 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  51.36 
 
 
291 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  51.36 
 
 
291 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  51.23 
 
 
284 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  51.02 
 
 
291 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  50.9 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  51.54 
 
 
291 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  50.9 
 
 
285 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  50.9 
 
 
285 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  50.9 
 
 
285 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  50.9 
 
 
285 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  50.9 
 
 
285 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  52.22 
 
 
291 aa  255  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  51.02 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  47.26 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  50.54 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  51.36 
 
 
291 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  51.02 
 
 
291 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  51.02 
 
 
291 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  48.07 
 
 
293 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  47.6 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  45.28 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  48.46 
 
 
291 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  49.18 
 
 
294 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  47.87 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  38.8 
 
 
292 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  38.8 
 
 
292 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  40.2 
 
 
284 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  43.01 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  41.75 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
274 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  42.11 
 
 
284 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  42.11 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  42.11 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  41.47 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  41.94 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  40.14 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  42.96 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  41.75 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  40.86 
 
 
293 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  42.09 
 
 
273 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  43.6 
 
 
277 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  39.22 
 
 
274 aa  167  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>