More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4932 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
193 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  81.44 
 
 
194 aa  297  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  72.02 
 
 
193 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  72.02 
 
 
193 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  72.02 
 
 
193 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  44.26 
 
 
203 aa  157  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  43.65 
 
 
200 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  43.89 
 
 
209 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  43.89 
 
 
209 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  43.33 
 
 
209 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  43.33 
 
 
209 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 
209 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 
209 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  40.84 
 
 
197 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.79 
 
 
204 aa  141  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.73 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  30.53 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.1 
 
 
174 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  36.41 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 
226 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 
234 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  36.08 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.84 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  33.99 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  35.61 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  33.5 
 
 
235 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  35.87 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  35.87 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  36.41 
 
 
196 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  30.04 
 
 
259 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  36.26 
 
 
202 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.9 
 
 
197 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  36.6 
 
 
224 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  32.07 
 
 
212 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  35.68 
 
 
192 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.49 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
209 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
209 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 
199 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
243 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  36.79 
 
 
184 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.96 
 
 
199 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  35.2 
 
 
198 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
199 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  41.44 
 
 
198 aa  101  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  35.48 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  31.82 
 
 
234 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  35.57 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  34.22 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
225 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  34.78 
 
 
190 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  35.56 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 
229 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
215 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  29.59 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  32.84 
 
 
211 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.65 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  27.19 
 
 
262 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  31.94 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  32.52 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  28.28 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 
201 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  34.68 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  36.05 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  27.08 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.18 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.12 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  27.23 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.18 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.12 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  28.02 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.96 
 
 
825 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.08 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.71 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  36.31 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  30 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  28.18 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  30.15 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.08 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  33.15 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  35.82 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  34.05 
 
 
819 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  34.48 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.03 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.47 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.72 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.72 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.72 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.57 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  30.23 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  34.1 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  31.02 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.57 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>