More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2116 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  53.55 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  48.85 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  51.65 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  40.78 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  41.9 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  45.6 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  46.96 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  41.99 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  53.94 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  52.94 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  36.78 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  38.12 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  46.41 
 
 		 190 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  42.27 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.84 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.84 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  40.59 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.36 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.36 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.91 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  46.29 
 
 		 175 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.35 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  38.8 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  33.7 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  36.65 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  40.12 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  39.66 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  37.78 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  34.17 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  36.21 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  39.46 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  35.6 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  37.16 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  37.16 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  33.68 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  34.24 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  33.33 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  32.78 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  35.29 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  34.97 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  31.67 
 
 		 243 aa  95.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.19 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  30.5 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.47 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  37.97 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  36.96 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  38.04 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  33.73 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.69 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.48 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  34.5 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  35.14 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.84 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  31.48 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  25.89 
 
 		 262 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.52 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  32.54 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  37.18 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  35.16 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.49 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.16 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  34.25 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  35.59 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  34.25 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 		 197 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.79 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  32.07 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  35.45 
 
 		 798 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  37.3 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  38.07 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  34.3 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>