More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2480 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 178 aa  347  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  56.57 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  55.43 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  59.06 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  51.16 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  54.86 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  45.14 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  35.16 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  41.04 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  39.23 
 
 		 203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  35.96 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.91 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  39.67 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.87 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  41.1 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  39.64 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 198 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  41.32 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  35.87 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  39.25 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 		 211 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  37.08 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  38.46 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  39.25 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  31.63 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  31.63 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  31.72 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 		 209 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.52 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 		 209 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  38.3 
 
 		 224 aa  94.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.22 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  34.25 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  40.56 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 229 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 229 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  34.86 
 
 		 196 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  30.11 
 
 		 226 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  32.78 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  30.6 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.89 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.89 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  35.06 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  36.22 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  36.22 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  40.8 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  36.22 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.09 
 
 		 296 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  32.61 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  27.42 
 
 		 234 aa  84.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.77 
 
 		 207 aa  84.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.89 
 
 		 211 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  33.15 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  38.92 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  33.51 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.82 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  30.9 
 
 		 827 aa  79.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  36.84 
 
 		 950 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  36.13 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  32.03 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  32.03 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.86 
 
 		 819 aa  77  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  30.5 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  29.67 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  36.09 
 
 		 974 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  26.91 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  27.49 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  36.09 
 
 		 962 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  30.89 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  32.98 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.05 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  30 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30.61 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  37.04 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  36.08 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.88 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.12 
 
 		 244 aa  74.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.21 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  30 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  31.61 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  27.5 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  30.54 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  33.51 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>