More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3864 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  98.48 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  45.41 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  38.86 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.83 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.79 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  32.83 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.87 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.04 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 226 aa  95.5  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  28.89 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.89 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  28.89 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.89 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  33.51 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.74 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.33 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.33 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  29.8 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.89 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  27.75 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  29.85 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.14 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.13 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  26.77 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  28.71 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  32.95 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  31.69 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  25.99 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  26.87 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  28.87 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  26.86 
 
 		 819 aa  75.1  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  29.72 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  28.65 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  29.23 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  31.47 
 
 		 234 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  28.07 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  24.88 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  32.63 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  26.29 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.91 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  32.28 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  27.92 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  31.89 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.68 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  27.36 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  27.5 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  25.37 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  24.76 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  28 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  28.16 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  28.25 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  27.41 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  28.16 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  28.41 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  25.14 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30.11 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  28.25 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  28.64 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  28.16 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  27.87 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  26.01 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  26.7 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  32.56 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>