More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0246 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  97.35 
 
 
234 aa  359  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  73.54 
 
 
187 aa  280  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  55.56 
 
 
183 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  44.91 
 
 
202 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  39.31 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  43.32 
 
 
192 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  42.17 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.16 
 
 
204 aa  94.4  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  35.6 
 
 
198 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.21 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  36.9 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.83 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  29.94 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.28 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.28 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  39.63 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  28.21 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  30.9 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 
200 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  30.21 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  30.59 
 
 
235 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.16 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  29.05 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  28.16 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  38.64 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.32 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  36.73 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  38.73 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  28.87 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  25.43 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  29 
 
 
825 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  28.07 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  28.07 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  26.52 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  28.07 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.34 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  31.4 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  31.4 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  31.4 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  30.23 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  29.12 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  27.91 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  26.09 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  31.87 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  28.5 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  27.18 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.6 
 
 
239 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  36.59 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  28.65 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  26.56 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  31.76 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.42 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  27.81 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.6 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  28.65 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  28.9 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  26.59 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.9 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.9 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33.58 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  28.9 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  33.55 
 
 
288 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.71 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.78 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  28.92 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  29.26 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  29.15 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.32 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  26.84 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  27.03 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  28.34 
 
 
827 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.32 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  26.92 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 
284 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  27.72 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.54 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  30.16 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  28.74 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.05 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  26.11 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  27.75 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  29.27 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  24.86 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  29.27 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  29.14 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>