More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1639 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  61.83 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  52.2 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  46.77 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  50 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  46.49 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  45.51 
 
 		 189 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  45.6 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.17 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  44.79 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.32 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  36.21 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  36.87 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  37.06 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  45.6 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.66 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  35.5 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  34.64 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  44.57 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  44.12 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  34.81 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  45.45 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  36.84 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.49 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  32.99 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  30.5 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  30.3 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  31.77 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  29.8 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  29.8 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  35.36 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  35.36 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  35.36 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35.56 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35.56 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  30.54 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  34.85 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  28.86 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 		 235 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  32.04 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.28 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  27.81 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  29.89 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  30.48 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.3 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  30.39 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  29.06 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  30.6 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  33.52 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  30.6 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.81 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.11 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  26 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  32.26 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  31.37 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  31.28 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  36.08 
 
 		 950 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.5 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  30.32 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  27.14 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  27.84 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  35.66 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  36.08 
 
 		 974 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  36.08 
 
 		 962 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  27.72 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  34.09 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  25.11 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  28.72 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  31.89 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  24.76 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.23 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  31.36 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  27.91 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  29.78 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  28.1 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>