More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0272 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  100 
 
 		 206 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  56.99 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  45.05 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  42.02 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  42.71 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  41.62 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  39.89 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  41.21 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  39.7 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  40.23 
 
 		 174 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  39.79 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  32.81 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  36.41 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  32.66 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  35.54 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  29.13 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  34.74 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  36.61 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  32.32 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  35.32 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  29.84 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  37.14 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  31.67 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.67 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.67 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  31.67 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.11 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.11 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  29.56 
 
 		 234 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 		 235 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  27.32 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  27.51 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  31.72 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  35.33 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  29.23 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  26.77 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  26.77 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  25.76 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.61 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  35.35 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.95 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.32 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  28.34 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  30.77 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  31.34 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  31.37 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  24.67 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  26.06 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  32.73 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  30.35 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  26.06 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  26.06 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  26.13 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  32.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.48 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  23.59 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  23.59 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.35 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  32.37 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  26.49 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.78 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  24.85 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  26.32 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  28.03 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  25.14 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  27.66 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  23.59 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  24.86 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  26.54 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  23.08 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  24.5 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  23.94 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  28.12 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  31.15 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  25.29 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  26.59 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  23.08 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  25.41 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>