More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0535 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  72.31 
 
 		 199 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  67.86 
 
 		 199 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  64.43 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  62.05 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  54.82 
 
 		 199 aa  218  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  57.36 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  55.61 
 
 		 201 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  58.79 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  46.46 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  41.54 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  43.63 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  43.63 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  43.63 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  44.72 
 
 		 234 aa  140  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  46.84 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  40.31 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  39.49 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  39.49 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  40.4 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  33.77 
 
 		 259 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  35.59 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  38.58 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.91 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  38.07 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  36.22 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  37.97 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  35.71 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  37.24 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  36.79 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  37.24 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.22 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  36.92 
 
 		 832 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.73 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.2 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.49 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  36.51 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  36.6 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  36.51 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.84 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  36.51 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.22 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 239 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 234 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  35.42 
 
 		 825 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  31.47 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  30.56 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  30.98 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  30.69 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.35 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.57 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  34.24 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  31.28 
 
 		 240 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.59 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  34.9 
 
 		 819 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  32.5 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  31 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  30.65 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  39.29 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  31.22 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.35 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  30.26 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  32.97 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  30.5 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  29.17 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  28.26 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  28.26 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.26 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  29.41 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.26 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.31 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  30.09 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  30.46 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.65 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  33.33 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  31.18 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  30.5 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  29.8 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.06 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>