More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3679 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  393  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  68.21 
 
 		 184 aa  231  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  58.64 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  51.63 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  50.58 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  47.34 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  35.38 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  42.63 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  35.03 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.03 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 		 187 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.2 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  37.3 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.34 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  35.75 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.98 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  34.22 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  36.92 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  38.62 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  37.97 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  35.23 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  35.23 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  35.23 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 225 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  35.52 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.8 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  39.78 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  35.52 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  33.69 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  30.52 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  38.8 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  30.52 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  30.52 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  37.3 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  32.77 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  38.86 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.89 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.89 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.08 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.63 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  36.1 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.03 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  31 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  34.02 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  26.29 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  28.43 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  30.37 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  28.64 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  39.46 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.1 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  32.12 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  29.34 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  27.6 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.02 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  28.38 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  37.42 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  31.36 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 		 832 aa  78.2  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  27.5 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.36 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.18 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  29.06 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.83 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  27.36 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  26.87 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.06 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  28.28 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  34.18 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.59 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.02 
 
 		 819 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.51 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  26.94 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  28.65 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  28.07 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  31.31 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  30.29 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  29.67 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  28.9 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0269  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.87 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  30.24 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  30.88 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  32.48 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  31.09 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  35.26 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.69 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  31.05 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  29.84 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>