More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2361 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  85.06 
 
 
240 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  81 
 
 
239 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  81 
 
 
239 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  76.82 
 
 
240 aa  361  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  72.61 
 
 
240 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  69.83 
 
 
234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  69.33 
 
 
234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  67.5 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  70.85 
 
 
236 aa  308  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  66.96 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  65.11 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  69.82 
 
 
248 aa  279  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  66.39 
 
 
234 aa  278  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  64.5 
 
 
239 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  66.23 
 
 
230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  66.23 
 
 
230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  60.09 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  43.1 
 
 
224 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  41.03 
 
 
235 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  38.43 
 
 
265 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  38.35 
 
 
256 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  38.87 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 
208 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  36.62 
 
 
832 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  37.86 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
234 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
208 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  37.38 
 
 
203 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  35.9 
 
 
208 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 
226 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.95 
 
 
204 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  29.9 
 
 
209 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  29.9 
 
 
209 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.86 
 
 
825 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  33.03 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.9 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  30.17 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 
225 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 
204 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.84 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.26 
 
 
827 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  32.08 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.96 
 
 
206 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.23 
 
 
221 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.99 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  34.01 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  31.92 
 
 
819 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
205 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  31.36 
 
 
743 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.14 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.03 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.19 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  31.03 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  38.16 
 
 
295 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  31.47 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  31.31 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  38.16 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  38.56 
 
 
295 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 
215 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  33.63 
 
 
974 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  33.49 
 
 
962 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 
204 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 
202 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 
198 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.16 
 
 
295 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  31.03 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.09 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  32.1 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  38.89 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.64 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.63 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 
295 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  32.65 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  32.86 
 
 
950 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  29.09 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>