More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3635 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  78.88 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  78.35 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  82.08 
 
 		 236 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  70.95 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  71.19 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  78.18 
 
 		 234 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  70.95 
 
 		 239 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  71.98 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  71.12 
 
 		 240 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  73.28 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  67.66 
 
 		 239 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  67.5 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  76.64 
 
 		 230 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  76.64 
 
 		 230 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  72.27 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  79.53 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  68.72 
 
 		 225 aa  291  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  47.44 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  39.26 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  43.05 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  39.92 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  37.45 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  41.09 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  39.38 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  34.96 
 
 		 832 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  34.88 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  37.63 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  31.84 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.83 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.91 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  32.75 
 
 		 288 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.9 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39.57 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  37.44 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  35.22 
 
 		 295 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 295 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.38 
 
 		 202 aa  95.5  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  31.08 
 
 		 201 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  95.1  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  33.16 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  31.51 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  33.18 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  34.5 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.08 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  30.59 
 
 		 293 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 198 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  34.02 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  34.94 
 
 		 290 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  31.08 
 
 		 293 aa  91.7  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.11 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.11 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  32.45 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.98 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.11 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.11 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.38 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.11 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  37.06 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  34.78 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  29.6 
 
 		 294 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  34.97 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  37.06 
 
 		 295 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  30.63 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  35.57 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.98 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 		 286 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  41.43 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 222 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  33.86 
 
 		 200 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  32.47 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  35.21 
 
 		 286 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.91 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  31.38 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.02 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>