More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0299 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  61.06 
 
 
224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  52.26 
 
 
265 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  52.85 
 
 
251 aa  221  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  52.42 
 
 
256 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  43.56 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  45.78 
 
 
240 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  45.54 
 
 
234 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  45.78 
 
 
240 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  43.05 
 
 
231 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  43.05 
 
 
234 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  43.23 
 
 
240 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  44.69 
 
 
239 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 
239 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  43.23 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  41.03 
 
 
241 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  44.54 
 
 
248 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  40.51 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  44.84 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  44.44 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  44.44 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  53.85 
 
 
326 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  53.79 
 
 
328 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  36.17 
 
 
208 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.2 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33.96 
 
 
202 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.05 
 
 
203 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  37.14 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.06 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  32.24 
 
 
832 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  31.42 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  31.42 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  30.56 
 
 
235 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.67 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  38.62 
 
 
743 aa  88.6  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  30.48 
 
 
825 aa  85.5  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 
295 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.73 
 
 
208 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.41 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  29.88 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  29.56 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.58 
 
 
827 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.22 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.84 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7137  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.73 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  33.11 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  31.31 
 
 
819 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  27.75 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  31.71 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  30.24 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.92 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  29.76 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.94 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5011  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.57 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565569  normal  0.0682866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.94 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
285 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 
295 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.59 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  28.78 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  28.88 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  29.51 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  30.81 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  29.86 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  28.44 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.1 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.8 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  28.96 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  28.96 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  28.96 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.96 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.52 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.45 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  28.96 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  29.51 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  28.96 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.59 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  31.07 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  28.96 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  28.99 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.85 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.11 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  30.27 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.73 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>