More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0440 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  43.84 
 
 
240 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 
241 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  42.08 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  41.09 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  40.1 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  42.08 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  41.58 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  41.09 
 
 
231 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  38.65 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  42.93 
 
 
234 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  36.17 
 
 
235 aa  121  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  41.5 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  43.98 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  33.76 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  34.73 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  38.16 
 
 
240 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  42.5 
 
 
234 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 
202 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  39.32 
 
 
240 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.79 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 
230 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 
230 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  41.5 
 
 
239 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.72 
 
 
208 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  34.6 
 
 
256 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  34.87 
 
 
832 aa  101  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  34.54 
 
 
209 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  34.54 
 
 
209 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.71 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  34.16 
 
 
205 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.57 
 
 
204 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  31.07 
 
 
197 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
197 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.98 
 
 
209 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  33.75 
 
 
180 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34.5 
 
 
743 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  33.75 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  33.75 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  33.16 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.87 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.41 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  31.03 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.18 
 
 
819 aa  85.9  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.16 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.33 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  32.07 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.46 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  28.95 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  33.16 
 
 
827 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  32.81 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.18 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.77 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  30.48 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  32.5 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  30 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  28.1 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  30 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  32.81 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  30 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  30.14 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.14 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  31.68 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.25 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  30 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  33.15 
 
 
882 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.35 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.95 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  31.68 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  31.52 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  34.46 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.24 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  35.6 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.82 
 
 
825 aa  79.7  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.29 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.35 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.35 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  31.21 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  31.05 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  30.93 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1786  cytochrome c oxidase subunit III  31.68 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>