More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2342 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  68.72 
 
 		 231 aa  291  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  68.72 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  64.45 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  60.08 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  60.5 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  61.99 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  63.03 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  62.5 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  60.09 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  57.87 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  63.98 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  63.98 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  65.26 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  62.09 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  62.09 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  60.18 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  60.19 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  43.72 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  36.72 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  38.14 
 
 		 251 aa  138  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  39.17 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  39.69 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  36.02 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  35.53 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.51 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40.51 
 
 		 295 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.87 
 
 		 295 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.87 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  36.45 
 
 		 832 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  34.6 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  40.88 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  37.65 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.74 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  40.14 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  41.96 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.75 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.72 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  32.23 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 		 293 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.2 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  40.44 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  33.78 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  36.71 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  33.18 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  33.65 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.42 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  37.35 
 
 		 293 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  36.02 
 
 		 295 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  36.08 
 
 		 286 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  38.18 
 
 		 286 aa  98.6  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  32.23 
 
 		 294 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  33.86 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  31.16 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  38.97 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.39 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  32.24 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  30.23 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.39 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  30.96 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  31.05 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 293 aa  95.5  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  34.69 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  31.63 
 
 		 297 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  35.46 
 
 		 293 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  38.3 
 
 		 284 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  34.81 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 		 289 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  31.67 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  34.81 
 
 		 286 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.8 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 		 295 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  32.46 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  32.32 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  36.03 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  34.81 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  36.03 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>