More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0265 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  94.06 
 
 		 286 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  82.87 
 
 		 286 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  82.52 
 
 		 286 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  82.52 
 
 		 286 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  69.37 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  69.86 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  70.21 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  65.98 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  61.51 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  64.69 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  68.31 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  67.96 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  61.51 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  61.51 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  62.2 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  65.73 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  68.31 
 
 		 285 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  67.96 
 
 		 285 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  67.96 
 
 		 285 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  67.96 
 
 		 285 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  68.31 
 
 		 285 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  61.86 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  67.61 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  62.2 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  67.61 
 
 		 285 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  60.48 
 
 		 293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  60.48 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  60.63 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  60.82 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  60.07 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  61.43 
 
 		 283 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  54.74 
 
 		 288 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  52.94 
 
 		 291 aa  301  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  51.89 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  54.8 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  53.33 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  52.92 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  52.58 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  52.6 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  53.07 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  53.71 
 
 		 289 aa  271  7e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  49.66 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  53.36 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  54.36 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  51.04 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  49.15 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  52.05 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  51.71 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  52.05 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  53.04 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  51.57 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  54.33 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  51.74 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  49.32 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  49.32 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  52.19 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  52.19 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  49.15 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  49.32 
 
 		 295 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  49.32 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  51.85 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  51.52 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  54.01 
 
 		 291 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  50.34 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  53.66 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  51.22 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  53.31 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  53.31 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  52.96 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  53.31 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  47.87 
 
 		 298 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  45.03 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  50.17 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  49.32 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  48.31 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  45.45 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  41.75 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  41.75 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  43.36 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  44.06 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  42.66 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  43.31 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  45.45 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  45.45 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  43.71 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  41.87 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  39.26 
 
 		 292 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  40.4 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  41.18 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  42.41 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>