More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1567 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  100 
 
 
234 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  84.58 
 
 
240 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  84.17 
 
 
240 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  82.43 
 
 
239 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  88.89 
 
 
230 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  88.89 
 
 
230 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  78.18 
 
 
231 aa  357  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  76.06 
 
 
236 aa  341  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  74.12 
 
 
234 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  74.77 
 
 
234 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  68.35 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  66.39 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  67.51 
 
 
239 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  68.12 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  67.69 
 
 
240 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  74.88 
 
 
248 aa  291  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  68.7 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  62.5 
 
 
225 aa  272  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  45.12 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  44.84 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  36.3 
 
 
265 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  39.41 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  39 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  42.5 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.71 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  36.92 
 
 
202 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 
203 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 
200 aa  98.6  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 
198 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.68 
 
 
209 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.51 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  37.37 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  33.94 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  35.23 
 
 
832 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.29 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.08 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  34.18 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  33.67 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.28 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.32 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 
295 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 
295 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  34.57 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  34.57 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  30.1 
 
 
209 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  30.1 
 
 
209 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 
295 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  38.32 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.22 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  36.59 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.79 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  38.58 
 
 
326 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
288 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  30.41 
 
 
211 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.63 
 
 
206 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.91 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  31.4 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.76 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  32.14 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.64 
 
 
825 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5791  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0858154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  39.16 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 
224 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  29 
 
 
195 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  34.57 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  29.79 
 
 
205 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.08 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  34 
 
 
819 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  31.38 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.96 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
211 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  32.98 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.33 
 
 
204 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.65 
 
 
296 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  31 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  29.65 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>