More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2704 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  49.04 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  48.56 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  49.04 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  47.06 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  44.93 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  44.08 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  40.27 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  36.54 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  46.27 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  45.03 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  40.69 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  42.61 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  42.61 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  43.69 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  46.11 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  42.59 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  42.57 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  45.23 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  32.64 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  47.12 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  44.72 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  48.45 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  34.44 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  43.81 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  41.92 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  41.54 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  46.19 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  39.15 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  38.61 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  40.62 
 
 		 832 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  40.1 
 
 		 819 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.33 
 
 		 174 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  36.04 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  37.43 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  35 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  37.1 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  37.1 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  37.1 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.65 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.8 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  36.36 
 
 		 825 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.73 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  35 
 
 		 206 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.23 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  34.02 
 
 		 827 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  31.46 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  30.41 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  31.6 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  30.71 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.16 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  32.6 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  33.66 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  36.56 
 
 		 194 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.6 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.78 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  30.45 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.6 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.7 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  30.84 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  35.29 
 
 		 184 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.96 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  29.72 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  35.35 
 
 		 950 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.55 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  33.62 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  33.62 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  29.81 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  33.62 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  33.62 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  35.35 
 
 		 974 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  31.98 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  35.53 
 
 		 305 aa  90.1  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  35.35 
 
 		 962 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 		 298 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  34.34 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.85 
 
 		 204 aa  88.6  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.02 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.44 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  30.65 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  31.89 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2644  cytochrome c oxidase subunit III  33.19 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.252638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>