More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7359 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  86.25 
 
 
240 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  85.42 
 
 
240 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  82.43 
 
 
234 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  82.85 
 
 
230 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  82.85 
 
 
230 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  69.53 
 
 
234 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  67.66 
 
 
231 aa  334  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  73.24 
 
 
236 aa  330  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  68.67 
 
 
234 aa  330  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  65.65 
 
 
239 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  64.56 
 
 
240 aa  297  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  64.5 
 
 
241 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  64.76 
 
 
239 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  60.24 
 
 
240 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  71.63 
 
 
248 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  65.94 
 
 
240 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  60.19 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  44.19 
 
 
224 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  44.69 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  38.84 
 
 
265 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  38.98 
 
 
251 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  38.33 
 
 
256 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  41.5 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.71 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 
208 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 
201 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  35.08 
 
 
208 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  36.22 
 
 
832 aa  99.8  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  37.63 
 
 
202 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.57 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  35.26 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  36.84 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  34.04 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  35.26 
 
 
204 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 
200 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  37.11 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  31.38 
 
 
198 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  34.18 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  31.46 
 
 
234 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.1 
 
 
226 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  35.11 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  37.07 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.12 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.12 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.94 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.04 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.09 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  34.36 
 
 
825 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.22 
 
 
206 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
222 aa  89  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  30.5 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.97 
 
 
295 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40.97 
 
 
295 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  40.29 
 
 
290 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40.97 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.91 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  32.71 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  30.69 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.91 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
288 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.74 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.55 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  30.32 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  30.09 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  34.22 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  36.22 
 
 
326 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.89 
 
 
206 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.91 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 
199 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 
211 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.68 
 
 
827 aa  85.1  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  31.53 
 
 
229 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  31.4 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.38 
 
 
204 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.98 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  33.51 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>