More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2591 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  94.98 
 
 		 239 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  85.4 
 
 		 240 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  76.17 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  81 
 
 		 241 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  79.66 
 
 		 240 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  70.95 
 
 		 231 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  69.46 
 
 		 234 aa  322  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  71.17 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  69.66 
 
 		 234 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  68.35 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  65.65 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  66.09 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  69.51 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  65.94 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  65 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  65 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  60.5 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  45.79 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  40.57 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  42.56 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  41 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  41.58 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  38.12 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.83 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.09 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.8 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.85 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  34.65 
 
 		 832 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.66 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.66 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  31.76 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.66 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  33.66 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.34 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  31.44 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  43.22 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  31.53 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 		 295 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.29 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.29 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.5 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  28.78 
 
 		 209 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  33.66 
 
 		 974 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  33.66 
 
 		 962 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  35.96 
 
 		 295 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 		 205 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  32.99 
 
 		 205 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.46 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  29.58 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  29.58 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 		 825 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  39.41 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  28.91 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4892  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  32.49 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  30.53 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29.74 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.06 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  30.46 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.66 
 
 		 819 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.61 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  28.92 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  33 
 
 		 950 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  32.99 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.92 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.82 
 
 		 206 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  29.78 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  31.48 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 210 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.46 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.1 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.47 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  36.07 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  37.84 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  31.98 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  36.25 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  37.06 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.06 
 
 		 296 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  29.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.1 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>