More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2959 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
289 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  98.27 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  61.05 
 
 
288 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  57.54 
 
 
284 aa  318  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  57.64 
 
 
288 aa  316  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  54.93 
 
 
291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  53.56 
 
 
295 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  55.25 
 
 
295 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  57.24 
 
 
283 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  55.25 
 
 
295 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  54.64 
 
 
291 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  54.92 
 
 
295 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  57.6 
 
 
288 aa  298  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  54.24 
 
 
295 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  54.83 
 
 
296 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  52.92 
 
 
291 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  55.12 
 
 
291 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  53.42 
 
 
291 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  54.27 
 
 
295 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  53.24 
 
 
295 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  52.9 
 
 
295 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  54.98 
 
 
298 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  52.25 
 
 
297 aa  287  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  54.92 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  55.67 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  55.12 
 
 
290 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  51.75 
 
 
293 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  50.86 
 
 
293 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  51.71 
 
 
293 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  51.89 
 
 
294 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  54.74 
 
 
286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  54.3 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  53.61 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  54.3 
 
 
291 aa  271  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  54.06 
 
 
286 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  53.61 
 
 
291 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  53.61 
 
 
291 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  54.64 
 
 
291 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  51.05 
 
 
293 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  53.26 
 
 
291 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  53.85 
 
 
286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  52.92 
 
 
291 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  49.13 
 
 
293 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  49.65 
 
 
293 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  54.96 
 
 
291 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  52.3 
 
 
286 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  53.1 
 
 
293 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  55.36 
 
 
291 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  53.61 
 
 
291 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  49.14 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  52.22 
 
 
294 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  53.61 
 
 
291 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  50.17 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  49.3 
 
 
293 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  52.3 
 
 
286 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  52.3 
 
 
286 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  49.49 
 
 
293 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  50.34 
 
 
295 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  49.15 
 
 
293 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  49.47 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  51.41 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  47.18 
 
 
284 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  51.06 
 
 
285 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  49.47 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  49.12 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  49.12 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  49.12 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  49.12 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  49.12 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  49.12 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  50.7 
 
 
285 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  50.7 
 
 
285 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  50.7 
 
 
285 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  50.7 
 
 
285 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  51.06 
 
 
285 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  50.35 
 
 
285 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 
285 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  49.47 
 
 
285 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  46.84 
 
 
304 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  51.03 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  46.64 
 
 
284 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  50.17 
 
 
295 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  39.59 
 
 
292 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  42.07 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  39.25 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  45.8 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  42.52 
 
 
292 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  41.98 
 
 
292 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  41.33 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  40.48 
 
 
439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  43.36 
 
 
284 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  43.36 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  40.99 
 
 
268 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  44.83 
 
 
288 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  42.05 
 
 
266 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  44.41 
 
 
285 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  44.14 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  41.81 
 
 
291 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>