More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1401 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  74.39 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  72.66 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  59.87 
 
 		 292 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  59.2 
 
 		 292 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  64.14 
 
 		 279 aa  339  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  62.42 
 
 		 285 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  62.85 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  62.5 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  60.6 
 
 		 292 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  62.46 
 
 		 288 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  62.32 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  62.54 
 
 		 285 aa  321  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  62.2 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  59.8 
 
 		 292 aa  318  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  61.75 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  62.06 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  62.89 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  59.39 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  59.18 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  58.97 
 
 		 439 aa  304  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  52.8 
 
 		 274 aa  298  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  56.48 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  62.94 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  62.06 
 
 		 284 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  54.42 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  61.19 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  61.19 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  55.48 
 
 		 266 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  55.9 
 
 		 291 aa  278  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  60.21 
 
 		 286 aa  278  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  61.43 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  61.43 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  55.12 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  55.12 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  53.63 
 
 		 271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  61.05 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  53.1 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  53.68 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  52.17 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  47.5 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  45 
 
 		 274 aa  223  4e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  47.2 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  44.2 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  45.64 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  43.2 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  44.86 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  43 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  43.42 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  41.4 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  40.7 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  40.85 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  40.41 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  41.22 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.59 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40.59 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  38.23 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  42.96 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  42.71 
 
 		 289 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  40.69 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40.26 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  40.69 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  42.71 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.66 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  42.21 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  41.26 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  41.34 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  40.26 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  38.94 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  41.53 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  38.94 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  41.41 
 
 		 298 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  42.91 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  38.06 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  40.48 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  38.61 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  42.06 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  41.94 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  39.22 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  41.9 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  40.07 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  37.93 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  41.94 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  39.66 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  39.66 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  39.72 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  39.72 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  39.31 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>