More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0281 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  89.82 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  89.82 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  89.82 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  89.82 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  89.82 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  89.82 
 
 
285 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  89.82 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  89.82 
 
 
285 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  90.18 
 
 
285 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  89.47 
 
 
285 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  87.72 
 
 
285 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  85.61 
 
 
285 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  85.96 
 
 
285 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  85.96 
 
 
285 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  85.96 
 
 
285 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  85.96 
 
 
285 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  85.96 
 
 
285 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  70.77 
 
 
286 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  70.42 
 
 
286 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  70.07 
 
 
286 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  69.37 
 
 
286 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  63.83 
 
 
284 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  62.15 
 
 
293 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  67.25 
 
 
286 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  67.73 
 
 
284 aa  363  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  61.81 
 
 
293 aa  363  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  62.11 
 
 
293 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  60.07 
 
 
294 aa  354  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  57.24 
 
 
293 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  59.65 
 
 
293 aa  351  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  59.31 
 
 
293 aa  349  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  58.62 
 
 
293 aa  347  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  58.28 
 
 
293 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  58.33 
 
 
293 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  57.29 
 
 
293 aa  331  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  53.41 
 
 
291 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  51.06 
 
 
284 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  50.7 
 
 
288 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  48.97 
 
 
295 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  49.48 
 
 
291 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  54.01 
 
 
295 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  51.42 
 
 
283 aa  268  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  51.06 
 
 
291 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  49.47 
 
 
288 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  50.54 
 
 
286 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  50.35 
 
 
295 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  50.35 
 
 
295 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  51.94 
 
 
288 aa  255  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  48.96 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  50.68 
 
 
298 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  47.96 
 
 
291 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  48.96 
 
 
295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  49.31 
 
 
295 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  48.96 
 
 
295 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  48.99 
 
 
296 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  49.47 
 
 
289 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  45.86 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  49.47 
 
 
289 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  45.76 
 
 
291 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  45.89 
 
 
297 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 
290 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  48.26 
 
 
294 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  47.28 
 
 
293 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  47.2 
 
 
291 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  48.47 
 
 
291 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  48.14 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  48.14 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  45.39 
 
 
294 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  48.14 
 
 
291 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  48.77 
 
 
291 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  48.6 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  47.47 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  47.46 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  47.9 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  46.78 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  46.78 
 
 
291 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  42.05 
 
 
304 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  44.41 
 
 
295 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  45.76 
 
 
294 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  44.22 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  45.76 
 
 
295 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  38.57 
 
 
292 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  38.23 
 
 
292 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  39.87 
 
 
292 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  38.62 
 
 
274 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  38.31 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  36.62 
 
 
268 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 
284 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 
291 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
292 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  37.68 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  37.68 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  40.22 
 
 
285 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  40.22 
 
 
277 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  39.32 
 
 
292 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  39.32 
 
 
439 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 
266 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  40.22 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  38.59 
 
 
292 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>