More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0833 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  88.34 
 
 		 284 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  87.37 
 
 		 284 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  85.96 
 
 		 285 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  85.26 
 
 		 284 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  82.61 
 
 		 284 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  82.61 
 
 		 284 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  82.11 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  82.11 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  73.21 
 
 		 287 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  73.08 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  73.57 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  72.14 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  73.65 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  73.65 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  65.87 
 
 		 292 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  65.87 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  71.53 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  65.53 
 
 		 292 aa  359  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  64.63 
 
 		 293 aa  351  8.999999999999999e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  63.82 
 
 		 292 aa  348  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  64.95 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  65.49 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  69.06 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  65.14 
 
 		 292 aa  338  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  70.25 
 
 		 287 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  65.51 
 
 		 286 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  60.07 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  63.97 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  62.54 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  65.84 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  61.03 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  63 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  63 
 
 		 266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  63 
 
 		 266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  59.36 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  60.42 
 
 		 284 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  54.01 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  53.93 
 
 		 270 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  53.82 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  49.25 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  49.08 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  44.85 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  45.19 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  45.21 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  45.21 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  41.55 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  43.6 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  44.72 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  41.89 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  41.14 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40.8 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  41.16 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  42.36 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.8 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  45.33 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.46 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  42.18 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  42.05 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  45.02 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  41.49 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  43.82 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  40.89 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  42.52 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  41.14 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  43.36 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  41.14 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.13 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  43.36 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  40.21 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  43.53 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  41.75 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  40.07 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.83 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  39.33 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  38.67 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  42.32 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  40.75 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  39.26 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  39.73 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  41.44 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  38.8 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  38.31 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  39.6 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  39.8 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  40.78 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  36.42 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  38.83 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  37 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  38.8 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  37.72 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  40.85 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>