More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2164 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  54.61 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  54.74 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  49.46 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  48.74 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  53.68 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  54.38 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  54.01 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  54.74 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  53.36 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  49.63 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  52.01 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  54.41 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  54.41 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  52.01 
 
 		 288 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  53.44 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  47.9 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  51.08 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  49.1 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  52.04 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  48.94 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  49.46 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  50.89 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  53.65 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  48.2 
 
 		 292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  51.84 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  54.15 
 
 		 284 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  54.15 
 
 		 284 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  48.93 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  51.47 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  48.23 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  47.78 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  53.31 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  50.17 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  48.31 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  48.69 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  46.44 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  51.84 
 
 		 287 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  47.71 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  43.12 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  42.91 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  47.71 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  47.71 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  41.79 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  40.97 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  40.07 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  39.01 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  41.84 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  39.22 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  38.87 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  40.91 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  40.48 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  37.72 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  38.51 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  38.52 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  40.98 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  38.03 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  43.16 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  43.1 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  39.38 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  38.97 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  43.16 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  36.61 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  37.1 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  36.71 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  37.58 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  37.29 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  36.95 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  37.98 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  38.64 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  35.79 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  39.16 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.72 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  39.3 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  39.02 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  37.63 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  39.02 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  39.02 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  37.58 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  37.72 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  38.68 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  39.73 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  39.04 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  41.32 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  36.97 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  37.28 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  37.28 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  37.28 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  37.28 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  37.63 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  37.28 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  37.28 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  36.9 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>