More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1829 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  100 
 
 		 266 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 266 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  95.86 
 
 		 266 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  77.24 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  70.44 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  64.68 
 
 		 279 aa  335  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  65.8 
 
 		 271 aa  328  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  64.84 
 
 		 270 aa  327  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  63.37 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  58.36 
 
 		 292 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  58.36 
 
 		 292 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  63 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  62.27 
 
 		 285 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  61.9 
 
 		 284 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  60.14 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  60.36 
 
 		 285 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  60.22 
 
 		 285 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  59.06 
 
 		 287 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  60.22 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  58.93 
 
 		 439 aa  298  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  62.64 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  58.36 
 
 		 292 aa  297  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  58.93 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  58.33 
 
 		 286 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  58.93 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  58.8 
 
 		 293 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  57.25 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  61.82 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  61.82 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  58.21 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  60.59 
 
 		 277 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  55.12 
 
 		 291 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  59.07 
 
 		 289 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  61.45 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  61.45 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  53.76 
 
 		 284 aa  271  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  54.04 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  57.91 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  55.6 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  48.68 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  45.56 
 
 		 274 aa  224  8e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  44.81 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  47.71 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  44.07 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  41.84 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  41.78 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  41.26 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  42.41 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  41.22 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40.88 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.88 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  41.32 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  42.05 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  40.62 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  41.34 
 
 		 289 aa  181  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  40.42 
 
 		 293 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  41.72 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  37.92 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  38.67 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  41.26 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.91 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  41.26 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  37.09 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  40.57 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  40.49 
 
 		 293 aa  178  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  40.97 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  39.93 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  42.2 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  41.26 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  39.24 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  38.75 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  38.98 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  41.49 
 
 		 283 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  39.08 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  38.93 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  37.54 
 
 		 291 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  36.73 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  37.72 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  38.03 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  37.93 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  41.22 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  38.43 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  38.73 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  39.44 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  40.14 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  38.19 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  40.14 
 
 		 285 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  40.14 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  38.06 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  39.79 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>