More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2332 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  66.67 
 
 		 270 aa  348  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  66.17 
 
 		 266 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  60.07 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  65.8 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  65.8 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  59.49 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  59.19 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  53.66 
 
 		 292 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  54.01 
 
 		 292 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  54.9 
 
 		 439 aa  281  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  54.9 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  54.42 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  54.58 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  55.59 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  53.98 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  53.63 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  56.32 
 
 		 285 aa  268  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  55.96 
 
 		 285 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  54.96 
 
 		 287 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  52.05 
 
 		 292 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  53.57 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  55.93 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  56.79 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  56 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  54.18 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  52.5 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  53.82 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  53.82 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  55.64 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  53.99 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  51.23 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  53.17 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  55.2 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  55.2 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  49.82 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  54.61 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  54.61 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  46.44 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  50.7 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  48.48 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  42.96 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  42.22 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  43.7 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  38.81 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  40.28 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  38.83 
 
 		 288 aa  168  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  37.07 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  37.76 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  38.78 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  37.76 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  39.79 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  39.49 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  36.75 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  39.44 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  37.92 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.63 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  37.41 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  37.59 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  40.07 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  36.68 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  35.02 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  37.98 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  37.63 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  36.81 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  36.88 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  34.6 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  36.75 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  37.02 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  33.56 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  36.33 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  34.26 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  36.4 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  36.93 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  38.73 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  33.1 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  38.95 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  36.59 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  36.33 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  34.35 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  34.92 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  34.26 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  35.82 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  34.26 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  34.6 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  34.26 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  34.6 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  33.91 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  34.6 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  37.23 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  37.15 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  33.56 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  35.29 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>