More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2202 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
251 aa  510  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  62.26 
 
 
265 aa  315  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  63.67 
 
 
256 aa  298  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  52.76 
 
 
224 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  52.85 
 
 
235 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  54.61 
 
 
326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  40.32 
 
 
240 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  41.42 
 
 
239 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 
239 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39.92 
 
 
231 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  38.91 
 
 
236 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  49.03 
 
 
328 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  38.26 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  37.76 
 
 
234 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  39.5 
 
 
234 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  41.53 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  41.53 
 
 
240 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  38.14 
 
 
225 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  40.42 
 
 
248 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  40.56 
 
 
240 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  38.87 
 
 
241 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  38.98 
 
 
239 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39.41 
 
 
234 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  38.14 
 
 
230 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  38.14 
 
 
230 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  33.76 
 
 
208 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.81 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  30.97 
 
 
832 aa  94.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  34.4 
 
 
205 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33.78 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.78 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.74 
 
 
204 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  30.91 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.78 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  29.65 
 
 
209 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  29.65 
 
 
209 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.4 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  29.55 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30.08 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  35.95 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.31 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  32.69 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  29.09 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  33.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.47 
 
 
819 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  35.29 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.94 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  29.55 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  35.95 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.29 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  27.85 
 
 
207 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.97 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  27.75 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  29.02 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  24.46 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  24.46 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  27.23 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  25.11 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  25.78 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.49 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  25.61 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  25.45 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  34.64 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  33.12 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  28.77 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  30.04 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.32 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  26.29 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  29.2 
 
 
827 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  32.24 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  29.46 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.04 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30.63 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  33.12 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  28.32 
 
 
825 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  25.69 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  28.87 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  27.96 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.15 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.21 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  27.96 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00007  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.94 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  27.59 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  31.47 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.6 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.05 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  29.96 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  26.59 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.6 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>