More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2265 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
202 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  93.1 
 
 
203 aa  374  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  51.56 
 
 
208 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  35.82 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  36.82 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  40 
 
 
743 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  41.01 
 
 
204 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.64 
 
 
215 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.26 
 
 
211 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.04 
 
 
215 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  35.98 
 
 
205 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 
211 aa  121  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.04 
 
 
215 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  34.15 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  35.75 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.22 
 
 
212 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.71 
 
 
209 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  34.65 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  35.36 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  38.07 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  43.42 
 
 
295 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  36.52 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.11 
 
 
211 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  36.55 
 
 
207 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 
203 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.62 
 
 
210 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.26 
 
 
202 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 
203 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  39.81 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  39.38 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.39 
 
 
210 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  37.62 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  42.76 
 
 
295 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 
210 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  34.08 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.92 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  42.11 
 
 
295 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  36.52 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2644  cytochrome c oxidase subunit III  37.81 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.252638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  34.34 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.46 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  33.5 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  40.62 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  41.46 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  42.11 
 
 
295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  34.16 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  34.16 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  35.59 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  45.31 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  32.67 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.01 
 
 
202 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.83 
 
 
204 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  45.31 
 
 
291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 
211 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  45.31 
 
 
291 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7137  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.92 
 
 
208 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.39 
 
 
222 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  34.69 
 
 
206 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.02 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  32.51 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  43.75 
 
 
291 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.96 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  43.75 
 
 
293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.16 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.25 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  37.86 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  44.53 
 
 
291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  36.31 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.25 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  38.16 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  44.53 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  39.66 
 
 
283 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.92 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  44.53 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  36.72 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  35.87 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  43.75 
 
 
291 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  34.18 
 
 
220 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
208 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  33.16 
 
 
214 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.29 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>