More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5675 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  78.54 
 
 
256 aa  378  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  63.81 
 
 
251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  53.52 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  51.41 
 
 
235 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  40.98 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  42.62 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  41.39 
 
 
239 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39.67 
 
 
231 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  40.91 
 
 
240 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  40.16 
 
 
234 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  53.09 
 
 
326 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  40.08 
 
 
234 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  40.08 
 
 
240 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  38.43 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  51.02 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  36.72 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  40.74 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  42.49 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  40.5 
 
 
240 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  40.5 
 
 
240 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  37.22 
 
 
234 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  38.84 
 
 
239 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  38.84 
 
 
230 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  38.84 
 
 
230 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  34.91 
 
 
832 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  34.73 
 
 
208 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  31.95 
 
 
208 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.61 
 
 
204 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  28.93 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.17 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.07 
 
 
202 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 
203 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  30.04 
 
 
211 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  32.9 
 
 
205 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30.99 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  30.43 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  30.43 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  28.51 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.51 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  31.03 
 
 
819 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.13 
 
 
215 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.14 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  28.03 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.75 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.13 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.45 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.75 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.39 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30.34 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.51 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.13 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  31.34 
 
 
743 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  28.44 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  28.7 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  28.51 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  33.14 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  26.92 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  34.07 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.11 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  31.68 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  28.45 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.62 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  30.89 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  31.68 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.07 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  32.12 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.18 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  30.3 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  30.04 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  26.64 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.35 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  28.15 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.31 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  28.23 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  28.71 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  26.64 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  28.51 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>