More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01165 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  100 
 
 		 326 aa  663    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  71.73 
 
 		 328 aa  457  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  47.67 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  54.61 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  54.86 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  53.85 
 
 		 235 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  50.75 
 
 		 224 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39.57 
 
 		 231 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  43.22 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  44.07 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  55.42 
 
 		 248 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  54.32 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  54.35 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  39.57 
 
 		 234 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 240 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  55.56 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  38.89 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  40.14 
 
 		 240 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  39.68 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  40.16 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  58.11 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  50.62 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  50.62 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  49.38 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  47.19 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2954  cytochrome c oxidase subunit III  23.77 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.179813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  42.17 
 
 		 832 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  44.05 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  39.77 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  48.19 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  45.83 
 
 		 743 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  44.71 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  44.16 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  44.16 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  44.16 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  46.99 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  38.14 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  40.58 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  32.58 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  43.84 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  42.86 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  31.86 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  35.37 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  41.56 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  40.58 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  26.55 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  36.25 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  43.66 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  27.56 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  44.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  26.29 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.6 
 
 		 214 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.43 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  28.92 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  37.68 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  37.68 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  39.33 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.23 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  33.6 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  36.08 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  33.6 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  36.08 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.87 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  31.96 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  33.64 
 
 		 974 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  29.2 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  36.99 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  44.93 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  44.93 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  43.55 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  41.54 
 
 		 825 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  33.64 
 
 		 962 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  29.2 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  36.84 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  29.2 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  41.1 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  32.67 
 
 		 798 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  29.2 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  30.09 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  30.09 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40.28 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.28 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  35.21 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  37.68 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 		 439 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  39.73 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  41.18 
 
 		 950 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  36.84 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  40.28 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  42.19 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  36.84 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  25.64 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>