More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5127 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  86.85 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  78.35 
 
 		 231 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  71.67 
 
 		 234 aa  346  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  69.46 
 
 		 239 aa  322  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  72.32 
 
 		 239 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  80.47 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  68.33 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  66.52 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  73.3 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  68.67 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  66.52 
 
 		 240 aa  314  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  69.33 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  72.44 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  64.34 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  68.12 
 
 		 230 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  68.12 
 
 		 230 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  64.45 
 
 		 225 aa  275  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  44.65 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  39.75 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  43.05 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  38.78 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  37.76 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  40.1 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  39.81 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  37.86 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  36.27 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  36.79 
 
 		 832 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  37.89 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  35.07 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.28 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  32.62 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  36.49 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  32.35 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 201 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  34.92 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39.57 
 
 		 326 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.12 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.12 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  34.74 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.85 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 		 209 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 288 aa  88.6  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  34.5 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.31 
 
 		 199 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  35.95 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  35 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  31.88 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  32.88 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.98 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  33.12 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  35.62 
 
 		 295 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  32.98 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.53 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.46 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  29.52 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.32 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  30.2 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  31.53 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.29 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  29.72 
 
 		 293 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  29.82 
 
 		 294 aa  85.1  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.46 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.21 
 
 		 283 aa  85.1  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  29.76 
 
 		 825 aa  85.1  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.5 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.2 
 
 		 209 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  29.79 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.95 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  31.44 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  35.67 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.95 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  29.58 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>